Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms