Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA4P34932 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA4P34932 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA4P34932 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA4P34932 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms