Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXP28300 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXP28300 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXP28300 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms