Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATF1P18846 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATF1P18846 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATF1P18846 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF1P18846 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF1P18846 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms