Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARF4P18085 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARF4P18085 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARF4P18085 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARF4P18085 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARF4P18085 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARF4P18085 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF4P18085 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF4P18085 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF4P18085 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF4P18085 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF4P18085 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF4P18085 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms