Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APELAP0DMC3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms