Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VIL1P09327 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms