Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms