Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK1P06493 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK1P06493 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK1P06493 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms