Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PF4P02776 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PF4P02776 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PF4P02776 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PF4P02776 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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