Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCAP01258 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCAP01258 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCAP01258 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCAP01258 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCAP01258 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCAP01258 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms