Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNKO75909 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNKO75909 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms