Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNC1O60486 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms