Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDIL3O43854 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDIL3O43854 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms