Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRC1O43663 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRC1O43663 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRC1O43663 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRC1O43663 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms