Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms