Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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