Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms