Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C1D1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C1D1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C1D1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C1D1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1D1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1D1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms