Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BNH8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BNH8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BNH8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BNH8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BNH8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BNH8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BNH8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms