Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms