Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL1BA8MQ27 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL1BA8MQ27 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms