Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4orf47A7E2U8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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