Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C5orf49A4QMS7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf49A4QMS7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms