Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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