Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms