Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms