Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD1Q9UP38 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms