Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms