Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALD1Q9ULE6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms