Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms