Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN2Q9UHD9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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