Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms