Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MSRB1Q9NZV6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSRB1Q9NZV6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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