Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms