Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms