Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1Q9HCU9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1Q9HCU9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms