Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC24A3Q9HC58 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC24A3Q9HC58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms