Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN2Q9H4D0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms