Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms