Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms