Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLVAPQ9BX97 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms