Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTA3Q9BTC8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms