Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms