Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBA1CQ9BQE3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms