Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms