Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MEIS3Q99687 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms