Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms