Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD27Q96NW4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms