Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms